Powstał na mocy Traktatu z Maastricht o utworzeniu Unii Europejskiej z 1991 r., który wszedł w życie w 1993 r. Został on powołany w celu zmniejszania różnic w poziomie gospodarczo-społecznym krajów i regionów Unii Europejskiej.
Fundusz Spójności wspiera dwa sektory: środowisko i transport. Od daty akcesji Polska stała się największym beneficjentem środków z Funduszu Spójności spośród wszystkich krajów członkowskich UE. Środki z Funduszu Spójności pomogą Polsce wywiązać się z zobowiązań akcesyjnych związanych z dostosowaniem do norm UE w najtrudniejszych i wymagających największych nakładów finansowych obszarach, w których Polska uzyskała najdłuższe okresy przejściowe. Wsparcie na duże projekty inwestycje z zakresu ochrony środowiska mogą uzyskać jednostki samorządu terytorialnego, tworzone przez nie związki gmin lub inne podmioty publiczne, np. przedsiębiorstwa komunalne będące własnością gminy.
Współfinansowanie z Funduszu Spójności mogą uzyskać inwestycje z takich dziedzin jak:
poprawa jakości wód powierzchniowych
polepszenie jakości i dystrybucji wody przeznaczonej do picia
racjonalizacja gospodarki odpadami i ochrona powierzchni ziemi
poprawa jakości powietrza
zapewnienie bezpieczeństwa przeciwpowodziowego
Główny serwis Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko